Paus Fransiskus juga melakukan dialog lintas iman dengan ratusan tokoh lintas agama di Indonesia. Dialog lintas iman ini menjadi perhatian utama Paus Fransiskus dalam kunjungannya ke Indonesia. Paus memandang Indonesia sebagai role model negara multikultural yang dapat hidup dalam suasana relatif damai.
Selain mengunjungi Masjid Istiqlal, Paus Fransiskus melanjutkan kunjungannya ke kantor Konferensi Waligereja Indonesia (KWI).
Ketua Konferensi Waligereja Indonesia (KWI), Mgr. Antonius Bunjamin Subianto, OSC, mengatakan bahwa kunjungan Paus Fransiskus ke Indonesia merupakan misi kemanusiaan dan misi persaudaraan.
